La alquimia, la ciencia más avanzada del mundo, comprende, descompone y reconstruye la materia bajo el principio de 'intercambio equivalente'. En esta alquimia, la mayor 'contraindicación' es la 'transmutación humana'. Hermanos jóvenes que violaron tabúes y lo perdieron todo por pensar en su difunta madre. Edward Elric, el hermano mayor que viste una armadura mecánica (automail) y lleva el nombre de 'Fullmetal Alchemist'. Alphonse Elric, el hermano menor cuya alma estaba fijada en una armadura gigante. Los dos se embarcan en un viaje para encontrar la Piedra Filosofal con el fin de recuperar lo que han perdido. A medida que los hermanos se acercan a la verdad de la Piedra Filosofal, se sumergen en medio de una gran conspiración. La existencia de aquellos que no son personas que actúan tras bambalinas. Amestris, una nación militar que revela poco a poco su verdadera naturaleza. El odio y la venganza interminables del pueblo oprimido. Muchas tragedias provocadas por la alquimia.