Dopo aver scoperto che Garmadon era ancora vivo ed assetato di vendetta, Wu decise di cercare quattro allievi per trasmettere loro i poteri degli elementi e trasformarli in ninja. Dopo aver trovato Cole, Jay e Zane si accorse che mancava ancora Kay, figlio del fabbro, Maestro del Fuoco, a cui aveva affidato la mappa delle Armi d'Oro. Kai inizialmente si rifiutò cacciando Wu; tuttavia il maestro rimase nelle vicinanze prevedendo un disastro imminente. Infatti poco dopo comparvero Samukai e gli scheletri intenzionati a rubare la mappa. Wu li sconfisse ma non riuscì a impedire che prendessero la mappa e la sorella di Kai, Nya. Volendo ritrovarla, Kai si affidò al maestro, e, dopo un lungo allenamento Wu gli fece conoscere gli altri allievi; dopodiché nominò Kai Maestro del Fuoco, Jay Maestro del Fulmine, Cole Maestro della Terra e Zane Maestro del Ghiaccio. In seguito partirono alla ricerca della Falce del Terremoto, che riuscirono a recuperare cacciando gli scheletri. Tuttavia, quando dovettero affrontare il drago guardiano, furono costretti a usare la Falce per difendersi, disobbedendo al maestro. Adirato, il maestro li rimproverò, per poi partire alla ricerca delle altre. Dopo aver recuperato il Nunchaku e gli Shuriken si diressero al Monte della Fiaccola dove si trovava la Spada del Fuoco. Sul monte, Kai fu ingannato da Garmadon, perdendo così la Spada ed il maestro, che precipitarono entrambi nell'Oltretomba. Kai salvò Nya e riuscì ad addestrare il Drago del fuoco. I Ninja persero anche le altre armi, e, con l'aiuto dei draghi degli elementi, si diressero verso l'Oltretomba. Intanto Samukai affrontò Wu con le Armi d'Oro e lo sconfisse, rubando la Spada del Fuoco; però, quando gli fu ordinato di consegnarle a Garmadon, si rifiutò abbagliato dal potere, ma, non riuscendo a gestirlo, collassò trasformandosi in un portale che consentì a Garmadon di fuggire dall'Oltretomba. I Ninja salvarono Wu e andarono a vivere con lui e Nya al monastero.

Gli eroi ninja Kai, Jay, Zane e Cole affrontano Lloyd Garmadon e i terribili serpenti che ha sguinzagliato per conquistare la terra di Ninjago.

Dopo la sconfitta del Great Devourer, Ninjago si gode finalmente un periodo di pace, ma l'armata delle Serpentine è ancora in agguato.

Dopo la sconfitta dell'Overlord, i ninja cominciano una nuova vita per scoprire ben presto che il male non resta a lungo sopito.

Mentre i ninja piangono la perdita di Zane, scoprono che c'è una possibilità di salvarlo partecipando a un misterioso torneo.

Uno spirito s'impossessa del corpo di Lloyd. Nya impara a usare i suoi veri poteri e i ninja cercano la tomba del Primo Maestro di Spinjitzu.

Un perfido Djinn chiamato Nadakhan viene liberato dalla teiera in cui è imprigionato e tenta di distruggere Ninjago City e rapire Nya, che intende sposare.

I ninja affrontano la più grande minaccia di sempre con i due Maestri degli Elementi che vogliono annullare la storia di Ninjago usando le loro potenti Lame del Tempo.

Una nuova banda criminale che si fa chiamare i Figli di Garmadon minaccia la famiglia reale di Ninjago. Tocca ai nostri eroi entrare in azione per proteggerla.