2056年，人类科技高度发展，太阳能，地热能，风能等环保能源被大量推行，人们过得富裕而满足。突然有一天，天才发明家J博士检测到这些环保能源突然消失了，马上要求全球安全基地作出应对，GSB基地最高指挥官伊特力排众议，调派基地5位精英特警，组成一支超自然现象调查队，简称“PSDU”，又名“钢铁飞龙”，执行调查能源消失的任务。可是在慢慢深入调查中发现，这个事件竟然是外星人在偷取地球的能源，邪恶外星人头目，残忍阴险的“魔尊”每次都成功阻挠钢铁飞龙的行动，夺走了能源，炽焰等人发现自己正缓缓地步入一个巨大的阴谋之中，而他们却迟迟找不到外星人的证据，找到了还被人秘密删除，甚至因为被“魔尊”他们栽赃嫁祸而成为全球头号通缉犯。 幸好得到J博士的帮助，在人类和外星人的夹攻下，最终决战一触即发，钢铁飞龙能成功保护地球能源吗？当拨开重重迷雾时，他们发现这场巨大阴谋的策划者竟然是伊特......原来他成立钢铁飞龙，其目的是为了转移GSB基地的注意力，让钢铁飞龙他们去当替罪羊，遮掩罪行，让他们认识人类的愚蠢，从而走向反人类的道路。他们该如何应对这些阴谋诡计，和伊特做个了断呢？

　　故事以平凡小胖子乐乐的校园生活为背景，讲述钢铁飞龙——炽焰、深蓝、铁拳、Maggie、小星五位战士从未来世界穿越而来，在指导、带领乐乐在一次次击败怪兽的过程中，陪伴他成长为未来英雄的故事。全片除了有热血和冒险元素外，还会有小主角历险后的感悟，让孩子在英雄身上学会成长。

在未来，邪恶的天网率领着宇宙大军想要统治地球，司徒乐率领人类顽强抵抗，天网的部队节节败退。为了扭 转局势，天网派出大量怪兽回到过去，誓要把司徒乐扼杀在童年时期。在屡屡失败之后天网决定亲自回去收拾司 徒乐一行人。天网设下圈套，把司徒乐和钢铁飞龙送进《山海经》中的异世界，并驾驶亲手打造的机械山海怪兽，对司徒乐 他们发动猛攻。孤立无援之际，司徒乐和钢铁飞龙从《山海经》残页中发现了一股神秘的力量，并在这股力量的 帮助下召唤出了全新的山海神兽机甲。面对险象环生的山海世界，司徒乐和钢铁飞龙驾驶着全新的神兽机甲，一 次次击退了天网的怪兽，踏上了漫漫回家之路。乐乐与扶桑一战，出现了与现实世界中，跟丁佳宜极为相似的角色，危急情况下，救下乐乐，并触发了某种能 量，让钢铁飞龙5个机器人成功合体。打败扶桑的同时，也为下半部的故事发展留下悬念。

在一座名为海湾城的超级大都市里，少年炽焰与同班同学小星、美琪无意中发现校园竟然存在着神秘的社团，同时目睹高年级学生深蓝、铁拳和小雪追逐着一头小恐龙，好奇心促使炽焰三人去寻找答案，无意中发现了时空裂缝及其带来的一连串惊天秘密，随之校园及城市陆续陷入了混乱危机。炽焰、深蓝、美琪、小星、铁拳这五个性格各异的少年组建了钢铁飞龙战队，开始了磕磕碰碰又惊险刺激的冒险旅途……

钢铁飞龙战队少年们发现在海湾城里，出现了一群名为“捕梦者”的神秘怪兽，它们能够激发出人类内心中诸如自私、嫉妒、恐惧等负面的精神能量，以此来控制人类、强化自身。为了打败“捕梦者”及其背后的主使——外星邪恶势力谬博士，少年们再次召唤杰博士发明的神兵机甲，与“捕梦者”展开一次次较量。在这过程中，大家战胜“心魔”，改掉坏毛病，收获了感悟与成长。